WaveShop ist mit einigen Werkzeugen und einer Unzahl an Soundeffekten für das Bearbeiten einer Audiodatei ausgestattet. Beim Editieren greift er ausschließlich auf die Teile der Datei zu, die Sie als Anwender tatsächlich ändern wollen. Das Programm unterstützt eine breite Palette an Audioformaten, wozu AAC, AIFF, AU, AVR, CAF, FLAC, M4A, MAT4-5, MP3, OGG, RF64, VOC, WAV, W64 und XI gehören.

Neben einem Editor für ID3-Tags (Edit - Metadata) können Sie Teile ausschneiden, kopieren oder einfügen, Pausen ergänzen, die Lautstärke und Geschwindigkeit anpassen, Aus- und Einblenden, Umkehren und vieles mehr. Zudem lassen sich andere Audiodateien in die aktuell geöffnete Datei einbinden. Eine Datei als MP3 abzuspeichern geschieht nicht über die Exportfunktion, sondern via "Save as".